Новый метод выделения растительной ДНК

Во многих случаях молекулярные исследования растений требуют экстракции геномной ДНК высокого качества и в больших количествах. Однако исследуемые растения могут обладать различными видовыми физическими и биохимическими особенностями, препятствующими этому. "Мешать выделению ДНК могут, например, танины, вторичные метаболиты," - говорит доктор Томас Гивниш, руководитель нового исследования, опубликованного в октябрьском выпуске Applications in Plant Sciences группой ученых из Университета Висконсин-Мэдисон.

Совершенно очевидно, что для разных групп растений оказываются эффективными разные методики выделения ДНК. При необходимости получить большое количество высококачественной ДНК необходимо учитывать вид растений, с которым вы работаете, считают авторы публикации. Они взяли на вооружение метод выделения ДНК, основанный на использовании частичек парамагнитной целлюлозы MagnaCel от компании Promega (РМС). Технология изначально была разработана и используется в судебной экспертизе, где чаще всего имеют дело с мизерным количеством генетического материала. Авторы исследования оценили применимость данной технологии к выделению растительной ДНК и сделали сравнение с двумя наиболее популярными методами - с использованием колонок DNeasy Plant Mini Kit и цетилтриметиламмониумбромида (СТАВ). Был проанализирован широкий спектр видов цветущих растений - 25 видов растений из 21 семейства. По количеству выделенной ДНК новый метод РМС показал результат, в два раза превосходящий другие методы, более того, в отличие от СТАВ метода, в нем не используются опасные химические вещества.

Статистический анализ также показал достоверность существенных различий по качеству и количеству полученной ДНК как между тремя методами, так и между различными таксономическими группами растений. Таким образом, авторы публикации заявили об очевидном преимуществе нового метода в случаях, когда, в силу особенностей исследуемого растения, затруднительно получение достаточных количеств чистой высокомолекулярной ДНК.